Кайраккумская комплексная экспедиция образована в 1947 году на базе геологического предприятия треста «Средазцветметразведка», с целью изучения свинцово-цинкового месторождения Конимансур. В 1950 году для изучения рудной площади Центрального и Восточного Карияи Мазора при геологическом управлении была создана Карияи мазорская геологоразведочная экспедиция. С момента образования, экспедиция приступила к освоению рудных месторождений (Западный Конимансур, Тариекан, Замбарак, Чукурджилга и др.), которые в последствии стали минерально-сырьевой базой для Карияи мазарского горно-обогатительного комбината. После объединения геологических предприятий (Карияи мазорская, Алтынтопканская, Исфаринская) работы по освоению новых месторождений приняли комплексный характер. Подготовлены к освоению такие месторождения, как Восточный Конимансур, Восточный Алтынтопкан, Шохкадамбулак, Кончоч, Апрелевка, Бургунда, Кизилчеку, Чорби, Чашмадинор и много других объектов строительных материалов. В настоящее время экспедиция проводит комплекс геологических, гидрогеологических и инженерно-геологических работ на территории Сугдской области Республики Таджикистан. Численность сотрудников экспедиции составляет 229 чел.