Южная гидрогеологическая экспедиция создана 1 октября 1960 года. Сфера деятельности экспедиции — Центральный, Юго-Западный Таджикистан и Памир. Экспедиция проводит гидрогеологическую съемку различных районов республики, поисково-разведочные работы на воду для водоснабжения населенных пунктов и промпредприятий, специальные мелиоративные исследования и режимные наблюдения за подземными водами орошаемых массивов, инженерно-геологические исследования, поисково-разведочные работы с подсчетом запасов подземных вод для орошения, разведка минеральных и термальных вод, бурение скважин под свай опор мостов. При экспедиции имеется техническая библиотека и геологические фонды. В библиотеке имеются более 1200 книг, брошюр и журналов по отрасли гидрогеологии, инженерной геологии, геофизике, буровых работ и т.д. В геологических фондах экспедиции хранятся и используются для работы более чем 750 геологических отчетов, пояснительных записок и экспертных заключений. Численность работников экспедиции составляет 88 человек.